Monthly Archives: November 2015

Gabedit Untuk Menjalankan NWChem dan Psi4

Dalam linux, apabila kita install NWChem dan Psi4 maka hanya akan berjalan di terminal, baik ketika instalasi maupun ketika menjalankannya. Sebagian orang kurang suka/terbiasa bekerja di terminal karena mesti menghafal “command” dan aturan tulis lainnya, akhirnya tidak mau menggunakan software yang running di terminal, seperti Abinit, NWChem dan Psi4.

Ada satu aplikasi yang bisa digunakan untuk menjalankan software itu secara visual yaitu Gabedit (http://gabedit.sourceforge.net). Gabedit adalah buatan Abdul Rahman Allouche (A.R. ALLOUCHE, Gabedit – A graphical user interface for computational chemistry softwares, Journal of Computational Chemistry, 32, 174-182(2011)) yang merupakan graphical User Interface untuk software FireFly, GAMESS-US, Gaussian, Molcas, Molpro, OpenMopac, Orca, MPQC, NWChem, Psicode (Psi3, Psi4), Q-Chem dan paket kimia komputasi under terminal.

Langkah-langkahnya sebagai berikut:

  1. Install Gabedit, diterminal Ubuntu ketik: sudo apt-get install gabedit,
  2. Install Avogadro yang akan digunakan untuk menyiapkan file input NWChem dan Psicode. Ketik di terminal: sudo apt-get install avogadro. Manual Avogadro bisa dibaca di http://manual.avogadro.cc/content/index.html
  3. Install NWChem dan Psi4. Ketik di terminal: sudo apt-get install nwchem psi4
  4. Jalankan Avogadro untuk membuat file input, gambar molekulnya, lakukan dulu AutoOptimization, lalu simpan.
    avogadro
  5. Klik menu Extensions, pilih NWChem, isi NWChem Input untuk menyiapkan file input, lalu klik button Generate… untuk menyimpan molekul yang ada di layar editor Avogadro dengan ekstensi .nw, yaitu file input NWChem,
    Continue reading

Leave a Comment

Filed under Kimia, Komputasi, Linux